OS X güncellemelerinde verileriniz aynen korunur fakat ne olur ne olmaz denilerek Time Machine yedeği öneriliyor.
Ben yedekleme yapmayı pek sevmediğim için ML'dan Mavericks'e yedeksiz yükselttim. Mavericks'ten Yosemite'ye de aynı şekilde.
Hiçbir sorun yaşamadım, siz de büyük ihtimalle veri kaybı yaşamazsınız fakat %100 garanti verilemiyor ne yazık ki.